基于分子对接和网络药理学分析金银花黄连治疗
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【关键词】
【摘要】背景:有研究表明金银花、黄连中多种单体治疗关节假体周围感染有效,关于金银花、黄连单独作用的研究较多,但金银花-黄连的共同药理作用机制鲜有文献报道。目的:基于分子对接和网络
背景:有研究表明金银花、黄连中多种单体治疗关节假体周围感染有效,关于金银花、黄连单独作用的研究较多,但金银花-黄连的共同药理作用机制鲜有文献报道。目的:基于分子对接和网络药理学手段探究金银花-黄连治疗关节假体周围感染的潜在有效成分、靶点和作用机制。方法:通过传统中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)筛选金银花、黄连的有效成分和靶点基因。使用人类基因数据库(GeneCards)和在线孟德尔遗传数据库(OMIM)获得关节假体周围感染靶点基因,取交集后获得金银花-黄连与关节假体周围感染的交集基因。通过STRING数据库构建靶点蛋白质之间相互作用(PPI)网络,利用Cytoscape 3.7.2软件中"Cyto NCA"插件对该PPI网络做拓扑分析和核心靶点筛选,再通过Cytoscape 3.7.2软件构建"中药-有效成分-交集靶点-疾病""有效成分-交集靶点"和"通路-富集基因"网络。利用DAVID在线工具进行交集靶点的基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并通过分子对接验证有效成分与靶点亲和力。结果与结论:①通过数据库筛选获得金银花治疗关节假体周围感染的有效成分14个及对应靶点183个,黄连治疗关节假体周围感染的有效成分9个及对应靶点158个;②共获得关节假体周围感染相关基因286个,药物和疾病的交集基因37个,PPI网络筛选出白细胞介素6等17个核心基因;③GO功能富集显示,金银花-黄连治疗关节假体周围感染的生物功能共有59个,其中生物过程44个,细胞组分6个,分子功能9个;④KEGG通路富集共筛选出17条信号通路;⑤分子对接结果显示,槲皮素、木犀草素、山柰酚与白细胞介素6、基质金属蛋白酶9、白细胞介素1β具有良好的亲和力;⑥结果证实,金银花-黄连治疗关节假体周围感染的具体机制涉及槲皮素和木犀草素等多个有效化合物,南美锥虫病和肿瘤坏死因子信号通路等多个作用途径,白细胞介素6和前列腺素内过氧化物合酶2等多个靶点基因,这些化合物、靶点基因和途径可共同协调药物发挥治疗作用。此外,文章还发现了潜在有效成分槲皮素,为后续深入研究提供了新导向和新思路。
文章来源：《北京中医药》 网址: http://www.bjzyyzz.cn/qikandaodu/2021/0301/544.html